Servicio Interacciones Biofísicas – SPR/ITC
Quiénes somos.
La Unidad de Interacciones Biofísicas (UIB), es una unidad de servicio perteneciente al Instituto de Química Médica del CSIC (IQM-CSIC). Nuestra labor principal consiste en ofrecer un servicio altamente especializado, tanto para centros del CSIC como para organismos externos (universidades, OPis, centros privados, etc), proporcionando apoyo a los grupos de investigación y empresas privadas pertenecientes al campo de la biomedicina e industria farmacéutica. Para ello hacemos uso de tecnología puntera en el campo de la biofísica como es la Resonancia de Plasmón en Superficie (SPR) o la Microcalorimetría de Valoración Isoterma (ITC).
Mediante el uso de ambas tecnologías se pueden estudiar las siguientes interacciones:-
Fármaco-Receptor
-
Proteína-Proteína
-
Carbohidrato-Proteína
-
Lípido-Proteína
-
Antígeno-Anticuerpo
-
DNA-proteína
-
DNA-molécula pequeña
-
Liposomas-proteínas
El análisis de los datos por parte de la unidad, proporciona a los usuarios información de alto valor científico que se traducen en publicaciones en revistas científicas, tesis doctorales o trabajos de máster.
Servicios.
Resonancia de Plasmón de superficie (SPR).
La unidad dispone de un equipo de SPR (Biacore X-100), que permite detectar y monitorizar interacciones entre dos o más moléculas en tiempo real sin emplear ningún tipo de marcaje.
Los estudios que pueden llevarse a cabo sirven para determinar:
- Especificidad (ensayos unión yes/no)
- Cinética: constantes de velocidad de reacción (kon y koff)
- Afinidad: constante de disociación (KD)
Entre sus principales ventajas se encuentra su gran sensibilidad, fundamental en el caso de interacciones fármaco-diana. Mediante la selección de los candidatos a fármacos frente a su diana se obtiene información acerca de la relación estructura-función, necesaria para dirigir la síntesis hacia el mejor candidato o "hit".
Los tipos de muestras que se pueden analizar en nuestro equipo incluyen proteínas, péptidos, lípidos, anticuerpos, compuestos orgánicos (fármacos), etc.
Microcalorimetría de Valoración Isoterma (ITC).
La unidad dispone de un equipo PEAQ-ITC (Malvern Instruments) que detecta el calor que absorbe o desprende la interacción entre dos biomoléculas a temperatura constante.
Mediante ITC se pueden obtener los siguientes parámetros de la interacción:
- Afinidad: KD (M)
- Entalpía: ΔH
- Entropía: ΔS
- Estequiometría: (n)
Al ser medidas en disolución es el complemento perfecto al equipo de SPR de la Unidad. También sirve para discernir entre moléculas que tienen la misma afinidad, pero presentan diferentes parámetros termodinámicos (relevante en el caso de interacción fármaco-diana).
Esta metodología permite trabajar con todo tipo de biomoléculas, puediéndose realizar medidas en diferentes solventes y medios, además de poseer la ventaja de no necesitar un marcaje de ninguna de las moléculas.
Equipamiento.
Equipos biofísicos
- Biacore X 100
- MicroCal PEQ-ITC (Malvem Instruments)
Equipos auxiliares
- Tycho NT6 (Nanotemper)
- NanoDrop One (Thermo Scientific)
Cursos.
-
Resonancia de plasmón de superficie como herramienta en el descubrimiento de un fármaco y caracterización de otras interacciones entre biomoléculas
Curso impartido a través del Gabinete de formación del CSIC y dirigido a personal científico y técnico que necesite adquirir estos conocimientos. Preferentemente los que prestan sus servicios en el Instituto de Química Médica. El curso abarca aspectos teórico-prácticos que capacitan al alumno en el desarrollo de experimentos básicos y avanzados de SPR para la caracterización de interacciones en el desarrollo de fármacos, así como la familiarización con software específico de tratamiento de datos.
Descargar programa
Publicaciones.
-
Crystal structure of the HMGA AT-hook 1 domain bound to the minor groove of AT-rich DNA and inhibition by antikinetoplastid drugs.
Nué-Martinez JJ, Maturana M, Lagartera L, Rodríguez-Gutiérrez JA, Boer R, Campos JL, Saperas N, Dardonville C. Sci Rep (2024)14:26173. doi: 10.1038/s41598-024-77522-3
-
Detection of Tumor-Associated Autoantibodies in the Sera of Pancreatic Cancer Patients Using Engineered MUC1 Glycopeptide Nanoparticle Probes.
Corzana F, Asín A, Eguskiza A, De Tomi E, Martín-Carnicero A, Martínez-Moral MP, Mangini V, Papi F, Bretón C, Oroz P, Lagartera L, Jiménez-Moreno E, Avenoza A, Busto JH, Nativi C, Asensio JL, Hurtado-Guerrero R, Peregrina JM, Malerba G, Martínez A, Fiammengo R. Angew Chem Int Ed Engl (2024) 63: e202407131. doi: 10.1002/anie.202407131
-
Sythesis and Biophysical and Biological Studies of N-Phenyl-benzamide derivatives targeting kinetoplastid parasites.
Nué-Martinez JJ, Cisneros D, Moreno-Blázquez MDV, Fonseca-Berzal C, Manzano JI, Kraeutler D, Ungogo MA, Aloraini MA, Elati HAA, Ibáñez-Escribano A, Lagartera L, Herraiz T, Gamarro F, de Koning HP, Gómez-Barrio A, Dardonville C. J Med Chem (2023) 66:13452-13480.
-
Novel indolic AMPK modulators induce vasodilatation through activation of the AMPK-eNOS-NO pathway.
Sanz-Gomez M, Aledavood E, Beroiz-Salaverri M, Lagartera L, Vega-Martín E, Gil-Ortega M, Cumella J, Pérez C, Luque FJ, Estarellas C, Fernández-Alonso MS, Castro A. Sci Rep (2022).12:4225
-
Neuroprotective Effect of IND1316, an Indole-Based AMPK Activator, in Animal Models of Huntington Disease.
Vela M, García-Gimeno MA, Sanchis A, Bono-Yagüe J, Cumella J, Lagartera L, Pérez C, Priego E, Campos A, Sanz P, Vázquez-Manrique RP, Castro A. ACS Chem Neurosci. (2022) 13 :275-287.
-
DD04107-Derived neuronal exocytosis inhibitor peptides: Evidences for synaptotagmin-1 as a putative target.
Butrón D, Zamora-Carreras H, Devesa I, Treviño MA, Abian O, Velázquez-Campoy A, Bonache MÁ, Lagartera L, Martín-Martínez M, González-Rodríguez S, Baamonde A, Fernández-Carvajal A, Ferrer-Montiel A, Jiménez MÁ, González-Muñiz R.Bioorg Chem (2021) 115:105231
-
Correlation between Biophysical Properties of Niosomes Elaborated with Chloroquine and Different Tensioactives and Their Transfection Efficiency.
Sainz-Ramos M, Villate-Beitia I, Gallego I, Al Qtaish N, Menéndez M, Lagartera L, Grijalvo S, Eritja R, Puras G, Pedraz JL. Pharmaceutics. (2021) 13:1787
-
The structure and flexibility analysis of the Arabidopsis synaptotagmin 1 reveal the basis of its regulation at membrane contact sites.
Benavente JL, Siliqi D, Infantes L, Lagartera L, Mills A, Gago F, Ruiz-López N, Botella MA, Sánchez-Barrena MJ, Albert A. Life Sci Alliance. (2021) 18:4
-
Deciphering Structural Determinants in Chondroitin Sulfate Binding to FGF-2: Paving the Way to Enhanced Predictability of their Biological Functions.
Vessella G, Vázquez JA, Valcárcel J, Lagartera L, Monterrey DT, Bastida A, García-Junceda E, Bedini E, Fernández-Mayoralas A, Revuelta J. Polymers. (2021) 13:313.
-
Targeting the neuronal calcium sensor DREAM with small-molecules for Huntington's disease treatment.
Lopez-Hurtado A, Peraza DA, Cercos P, Lagartera L, Gonzalez P, Dopazo XM, Herranz R, Gonzalez T, Martin-Martinez M, Mellström B, Naranjo JR, Valenzuela C, Gutierrez-Rodriguez M. Sci Rep. (2019) 9:7260
-
Identification of IQM-266 as a New Activator of KV4 Currents Mediated by the Accessory Protein DREAM.
Cercos P, Peraza DA, Miaja P, Merinero YG, Lagartera L, Martín-MartínezM, Naranjo JR, Gutiérrez-Rodríguez M, Valenzuela C. Front Mol Neurosci (2019) 12:1-14
-
Assembly of glycoamino acid building blocks: a new strategy for the straightforward synthesis of heparan sulfate mimics.
Revuelta J, Fuentes R, Lagartera L, Hernáiz MJ, Bastida A, García-Junceda E, Fernández-Mayoralas A. Chem Commun. (2018). 54:13455-13458.
-
Structural and Mechanistic Insights into the Catalytic-Domain-Mediated Short-Range Glycosylation Preferences of GalNAc-T4.
De Las Rivas M, Paul Daniel EJ, Coelho H, Lira-Navarrete E, Raich L, Compañón I, Diniz A, Lagartera L, Jiménez-Barbero J, Clausen H, Rovira C, Marcelo F, Corzana F, Gerken TA, Hurtado-Guerrero R. (2018) ACS Cent Sci. 4:1274-1290.
Tarifas.
Ponte en contacto con nosotros y solicita un presupuesto adaptado a tu proyecto: Tarifas 2024
Contacto: uib.spr@iqm.csic.esDra. Laura Lagartera Ortíz
Responsable científico
Laboratorio 202/206B
Tfno: 912587438 (Ext. 443356)
l.lagartera@iqm.csic.esD. Juan Antonio Rodríguez Gutiérrez
Personal técnico
Laboratorio 202/206B
Tfno: 912587592 (Ext. 443372)
ja.rodriguez@csic.es